召集壮士帮忙测试 TinyTeX

dapengde · 2017年12月22日

yihui 网友见面我总是紧张，尤其是男网友，尤其是男偶像。手都不知道往哪儿放了。PS：Perl 是哪里来的，真不知道。

感谢偶像帮我修电脑！

PPS: 又查了一下，我的 Windows 下有一个叫 Strawberry Perl 的安装，和一个 ActivePerl 的安装。你远程看到的 c:/perl 来自后者。根据安装时间猜测，我可能是在折腾某些在 linux 容易安装但是在 windows 不容易安装的东西时，按网上的方法装上去的，可能是 python 的某个库或者别的什么东西——完全不记得了。

我卸载了这两个 Perl 之后，即使不使用你今天施的法术，而保留 latexmk.exe 原来的样子，也可以正常编译了！那么说到底这个锅是 perl 来背咯？perl 在 latex 里多管闲事？

yihui · 2017年12月22日

dapengde Perl 是躺着中枪，只是因为 latexmk 包本来是用 Perl 写的而已。真正的锅还是该 MiKTeX 里的 bibtex 来背，它是麻烦的根源。它看见 foo.bib 时非要认为是 foo.bib.bib，为了向它投降，我们必须把扩展名去掉，而去掉扩展名会导致文档不具有可移植性（某个工具下能编，换个工具就不能编）。可移植性比隐藏扩展名要重要多了，这一点 MiKTeX 中的 bibtex 的作者可能不太认同（估计伊不用非 Windows 的系统），而 latexmk.exe 又没像我一样对这个问题打补丁，放任 bibtex 出错。既然它不打补丁，我只好把它默认辞退了。

dapengde · 2017年12月22日

yihui 明白了。目前是在 bookdown 里编译就没问题，但是在 cmd 里或者 texstudio 里编译 tex 文件仍然是在傻傻地找 foo.bib.bib. 也就是说， bookdown / rmarkdown 为 bibtex 填坑的行为受到了我电脑里 perl 的干扰，而其他软件根本连 bibtex 的坑都没填。

你上面多次提到的为 bibtex 填坑的行为，我一直很困惑，就是因为我这里 perl 的存在导致我这里这个坑压根儿就没填上。

这也解释了为何我最初用 bookdown 没这问题——当时是今年 3 月份，而我的 Perl 是 5 月份安装了。

这正是小白长得像哥哥：真相大白。

yihui · 2017年12月22日

dapengde 完全正确。你不能通过纯 LaTeX 命令行或者 TeXStudio 编译。当然，其实 Rscript -e "rmarkdown::render('foo.Rmd')" 也是命令行。

Cloud2016 · 2017年12月23日

yihui 经测试没问题，可以正常编译出pdf。是在 R 内设置 Sys.setenv('PATH') 追加 TinyTeX 路径？
#L50

yihui · 2017年12月23日

Cloud2016 是的，只是在有必要的情况下（条件：系统是 Linux、~/bin/tlmgr 存在但通过 Sys.which() 找不到或者找到的不是它），临时调整 PATH，编完了再恢复。

JackieMe · 2017年12月23日

yihui
我本身除了 TinyTeX 之外没有装任何 TeX，使用 zsh，之前把 TinyTeX 路径自己加在~/.zshrc。
刚刚从~/.zshrc中PATH设置中去掉 TinyTeX 。然后：

devtools::install_github('yihui/tinytex')
tinytex::install_tinytex(force=TRUE)

重新安装。安装一切顺利。
之后直接打开 RStudio：

R >>> library(tinytex)
R >>> Sys.getenv('PATH')
[1] "/usr/local/bin:/usr/bin:/bin:/usr/local/games:/usr/games"
R >>> tinytex::is_tinytext()
Error: 'is_tinytext' is not an exported object from 'namespace:tinytex'

不管，直接打开测试的在R Markdown文档中使用中文.Rmd编译。报错：

pandoc: xelatex not found. xelatex is needed for pdf output.
Error: pandoc document conversion failed with error 41
Execution halted

貌似还是路径问题？找不到 xelatex。还是我配置问题？

但是测试编译xelatex('xxx.tex')文件是可以的，但是 RStudio 打开 tex 文件再点击 Compile PDF 还是提示找不到 XeLaTeX:

Unabled to find specified LaTeX program 'XeLaTeX' on the system path

所以如果要用 knitr还需要另外配置？

另外：

R >>> tlmgr_update()
tlmgr update --all --self
tlmgr: package repository http://mirrors.ustc.edu.cn/CTAN/systems/texlive/tlnet (verified)
sh: 1: fmtutil-sys: not found
R >>> tlmgr_search('fmtutil-sys')
tlmgr search --file --global 'fmtutil-sys'
tlmgr: package repository http://mirrors.ustc.edu.cn/CTAN/systems/texlive/tlnet (verified)
tetex:
	texmf-dist/doc/man/man1/fmtutil-sys.1
	texmf-dist/doc/man/man1/fmtutil-sys.man1.pdf
	texmf-dist/scripts/texlive/fmtutil-sys.sh
tetex.amd64-freebsd:
	bin/amd64-freebsd/fmtutil-sys
tetex.amd64-netbsd:
	bin/amd64-netbsd/fmtutil-sys
tetex.armel-linux:
	bin/armel-linux/fmtutil-sys
tetex.armhf-linux:
	bin/armhf-linux/fmtutil-sys
tetex.i386-cygwin:
	bin/i386-cygwin/fmtutil-sys
tetex.i386-darwin:
	bin/i386-darwin/fmtutil-sys
tetex.i386-freebsd:
	bin/i386-freebsd/fmtutil-sys
tetex.i386-linux:
	bin/i386-linux/fmtutil-sys
tetex.i386-netbsd:
	bin/i386-netbsd/fmtutil-sys
tetex.i386-solaris:
	bin/i386-solaris/fmtutil-sys
tetex.powerpc-darwin:
	bin/powerpc-darwin/fmtutil-sys
tetex.powerpc-linux:
	bin/powerpc-linux/fmtutil-sys
tetex.sparc-solaris:
	bin/sparc-solaris/fmtutil-sys
tetex.win32:
	bin/win32/fmtutil-sys.exe
tetex.x86_64-cygwin:
	bin/x86_64-cygwin/fmtutil-sys
tetex.x86_64-darwin:
	bin/x86_64-darwin/fmtutil-sys
tetex.x86_64-darwinlegacy:
	bin/x86_64-darwinlegacy/fmtutil-sys
tetex.x86_64-linux:
	bin/x86_64-linux/fmtutil-sys
tetex.x86_64-solaris:
	bin/x86_64-solaris/fmtutil-sys

这个？

yihui · 2017年12月24日

JackieMe 你需要

devtools::install_github(c('yihui/tinytex', 'rstudio/rmarkdown'))

另外，是 tinytex:::is_tinytex() 而不是 tinytex::is_tinytext()。

JackieMe · 2017年12月24日

yihui OK。install_github之后可以编译 Rmd 文件了。
tinytex::is_tinytex()命令去掉了是吧？

HarryZhu-7harryprince · 2017年12月24日

Cloud2016 洋人搞的rocker 不太实用

Cloud2016 · 2017年12月24日

HarryZhu-7harryprince 洋人搞的 rocker 可能他们很受用，看拉取次数还是很可观的。

JackieMe 是三个冒号哟

JackieMe · 2017年12月24日

Cloud2016 好吧，是我瞎了.....
第一次见还有:::的用法，长见识了。

yihui · 2017年12月24日

JackieMe 我懒得导出这个函数，你得用三个冒号调用内部函数。

Cloud2016 · 2018年1月12日

yihui

code.tex 文件内容如下：

\documentclass{ctexart}
\usepackage{minted}

\title{R语言}
\author{某某}

\begin{document}
\maketitle
\section{数据描述}

\begin{minted}{c}
int main() {
	printf("hello, world");
	return 0;
}
\end{minted}

\begin{minted}{python}
def boring(args = None):
	pass
\end{minted}

\begin{minted}{r}
require(stats) # for lowess, rpois, rnorm
plot(cars)
lines(lowess(cars))
plot(sin, -pi, 2*pi) # see ?plot.function
## Discrete Distribution Plot:
plot(table(rpois(100, 5)), type = "h", col = "red", lwd = 10,
     main = "rpois(100, lambda = 5)")
## Simple quantiles/ECDF, see ecdf() {library(stats)} for a better one:
plot(x <- sort(rnorm(47)), type = "s", main = "plot(x, type = \"s\")")
points(x, cex = .5, col = "dark red")
\end{minted}

\mint{python}|import this|

\end{document}

使用 minted 包的tex文件，需要在编译的时候使用-shell-escape参数，如果使用 tinytex::xelatex，不知道如何传这个参数？如果不能传递，谢大大是否可以再添加 args 选项让用户自己传递类似上述 -shell-escape 参数？

system2('xelatex', args = '-shell-escape code') # 没问题，但是要运行几遍才有目录索引

tinytex::xelatex(file = 'code.tex') 

# I was unable to find any missing LaTeX packages from the error log code.log.
# ! Package minted Error: You must invoke LaTeX with the -shell-escape flag.
# 
# Error: Failed to compile code.tex. See code.log for more info.
# In addition: Warning message:
#   running command '"xelatex" -halt-on-error -interaction=batchmode "code.tex"' had status 1

yihui · 2018年1月15日

Cloud2016 安装 Github 上最新版的 tinytex 包 devtools::install_github('yihui/tinytex')，然后

tinytex::xelatex('code.tex', engine_args = '-shell-escape')

应该就可以了。如果懒得每次都敲这个，可以设置全局选项：

options(tinytex.engine_args = '-shell-escape')

然后 tinytex::xelatex('code.tex')。

另外我建议你少花点时间折腾 minted 包。据我观察，你正在一步一步重复蹚我年少时蹚过的浑水，LaTeX 真的很浪费时间，投入产出严重不成比例。这种语法高亮的问题还是用 R Markdown 算了，Pandoc 已经把事情都给办好了。如果你真的闲得慌，我可以给你找一堆更有意义的事情来做。

dapengde · 2018年1月15日

yihui 你还说！要不是你鼓捣出来个 bookdown，我早就跟 LaTeX 决裂了！

Cloud2016 · 2018年1月15日

yihui 我在折腾学校的latex模版，还是先立足做好tex而不是R Markdown或者bookdown之类的模版，其实即使模版出来了，也没几个人会用，可见意义不大，只是自己有点强迫症，既然开始了就想做完做到自己满意。

谢大大可以列一个有意义的事件表，闲得慌的时候可以看看，如果力所能及还可以动动手

yihui · 2018年1月15日

dapengde 没办法，你是包的开发者，所以你注定要下地狱啃这块硬骨头，目的是为了让你的用户不必再啃它。

Cloud2016 如果你能把 R Markdown 套在学校的 LaTeX 模板上，那将会是一件非常有意义的事情，这事要是能办成，我愿意给你连续发一个星期的红包。单纯只是做出一个 LaTeX 模板并没有太大意义，因为那是把事情复杂化（疯狂自定义环境和命令）；更有意义的事情是把事情简单化，让用户一个 LaTeX 命令都看不到，还能站在 LaTeX 肩膀上把论文给写了。打倒学术界的排版（包括学校论文的排版）是我的人生目标之一。做这件事就是在 R Markdown 的强约束条件下求最优解（只有有限可用的元素），也就要求你克制自定义 LaTeX 命令和环境；“要做什么”不难，“不做什么”才难。

yihui · 2018年1月15日

Cloud2016 来来，给你安排个小任务，看你是否可以在 Windows 下重现这个帖子里的问题，可以的话帮忙修一下：https://d.cosx.org/d/419665-rmarkdown/30

Cloud2016 · 2018年1月16日

yihui 问题能重现，可是我不会修复，谢大大太瞧得起我啦

只要不用R Notebook输出html就没关系，警告信息不随html/PDF文件走

学校的模板比较奇葩，如参考文献格式还是国标2005版（现在是2015版），模板风格都是很多年前的，还有很多细节要调整 <https://github.com/XiangyunHuang/CUMTB-Master-Thesis>