Ubuntu 下 R Markdown 生成 PDF 文档里部分中文字符的乱码问题

确实是字体问题。

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documentclass: ctexart
output:
  rticles::ctex:
    keep_tex: yes
    includes:
      in_header: "header.tex"
---

下面二字显示出来:皞觍

header.tex 文件内容如下：

\setCJKmainfont[BoldFont={SimHei},ItalicFont={KaiTi}]{SimSun}

xfun::session_info()
R version 4.0.4 (2021-02-15)
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
Running under: Ubuntu 20.04.2 LTS, RStudio 1.4.1103

Locale:
  LC_CTYPE=zh_CN.UTF-8       LC_NUMERIC=C               LC_TIME=zh_CN.UTF-8       
  LC_COLLATE=zh_CN.UTF-8     LC_MONETARY=zh_CN.UTF-8    LC_MESSAGES=zh_CN.UTF-8   
  LC_PAPER=zh_CN.UTF-8       LC_NAME=C                  LC_ADDRESS=C              
  LC_TELEPHONE=C             LC_MEASUREMENT=zh_CN.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C       

Package version:
  base64enc_0.1.3   compiler_4.0.4    digest_0.6.27     evaluate_0.14     glue_1.4.2       
  graphics_4.0.4    grDevices_4.0.4   highr_0.8         htmltools_0.5.1.1 jsonlite_1.7.2   
  knitr_1.31        magrittr_2.0.1    markdown_1.1      methods_4.0.4     mime_0.10        
  rlang_0.4.10      rmarkdown_2.7     rticles_0.18      stats_4.0.4       stringi_1.5.3    
  stringr_1.4.0     tinytex_0.29      tools_4.0.4       utils_4.0.4       xfun_0.21        
  yaml_2.2.1      

2021 年 9 月27 日更新

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documentclass: ctexart
output: rticles::ctex
CJKmainfont: Noto Serif CJK SC
---

下面二字显示不出来:皞觍

系统环境

xfun::session_info()
#> R version 4.1.1 (2021-08-10)
#> Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
#> Running under: Ubuntu 20.04.3 LTS
#> 
#> Locale:
#>   LC_CTYPE=zh_CN.UTF-8       LC_NUMERIC=C              
#>   LC_TIME=zh_CN.UTF-8        LC_COLLATE=zh_CN.UTF-8    
#>   LC_MONETARY=zh_CN.UTF-8    LC_MESSAGES=zh_CN.UTF-8   
#>   LC_PAPER=zh_CN.UTF-8       LC_NAME=C                 
#>   LC_ADDRESS=C               LC_TELEPHONE=C            
#>   LC_MEASUREMENT=zh_CN.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C       
#> 
#> Package version:
#>   backports_1.2.1   base64enc_0.1.3   callr_3.7.0       cli_3.0.1        
#>   clipr_0.7.1       compiler_4.1.1    crayon_1.4.1      digest_0.6.27    
#>   ellipsis_0.3.2    evaluate_0.14     fansi_0.5.0       fastmap_1.1.0    
#>   fs_1.5.0          glue_1.4.2        graphics_4.1.1    grDevices_4.1.1  
#>   highr_0.9         htmltools_0.5.2   jsonlite_1.7.2    knitr_1.33       
#>   lifecycle_1.0.0   magrittr_2.0.1    markdown_1.1      methods_4.1.1    
#>   mime_0.11         pillar_1.6.2      pkgconfig_2.0.3   processx_3.5.2   
#>   ps_1.6.0          purrr_0.3.4       R.cache_0.15.0    R.methodsS3_1.8.1
#>   R.oo_1.24.0       R.utils_2.10.1    R6_2.5.1          rematch2_2.1.2   
#>   reprex_2.0.0      rlang_0.4.11      rmarkdown_2.10    rprojroot_2.0.2  
#>   rstudioapi_0.13   stats_4.1.1       stringi_1.7.4     stringr_1.4.0    
#>   styler_1.5.1      tibble_3.1.4      tinytex_0.33      tools_4.1.1      
#>   utf8_1.2.2        utils_4.1.1       vctrs_0.3.8       withr_2.4.2      
#>   xfun_0.25         yaml_2.2.1

^{Created on 2021-09-27 by the reprex package (v2.0.0)}

是 fandol 字体缺字，Ubuntu 下 ctex 默认使用 fandol，所以出现了这个问题。Ubuntu 和 Windows的字体都是可以的：

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documentclass: ctexart
classoption:
  # - fontset=windows
  - fontset=ubuntu
output:
  rticles::ctex:
    keep_tex: yes
---

下面二字显示不出来:皞觍

> sessionInfo()
R version 4.0.3 (2020-10-10)
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
Running under: Ubuntu 20.10

Matrix products: default
BLAS:   /usr/lib/x86_64-linux-gnu/blas/libblas.so.3.9.0
LAPACK: /usr/lib/x86_64-linux-gnu/lapack/liblapack.so.3.9.0

locale:
 [1] LC_CTYPE=en_US.UTF-8       LC_NUMERIC=C               LC_TIME=en_US.UTF-8        LC_COLLATE=en_US.UTF-8    
 [5] LC_MONETARY=en_US.UTF-8    LC_MESSAGES=en_US.UTF-8    LC_PAPER=zh_CN.UTF-8       LC_NAME=C                 
 [9] LC_ADDRESS=C               LC_TELEPHONE=C             LC_MEASUREMENT=en_US.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C       

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     

loaded via a namespace (and not attached):
 [1] compiler_4.0.3    htmltools_0.5.1.1 tools_4.0.3       rticles_0.18      yaml_2.2.1        rmarkdown_2.7     knitr_1.31       
 [8] xfun_0.21         digest_0.6.27     rlang_0.4.10      evaluate_0.14

如果真的遇到了 Windows 字体才有的字，可以把所有 Windows 字体复制到 Ubuntu，然后使用 fontset=windows 选项。

dapengde 很遗憾，听我那个朋友说，你们提交的书稿那边貌似还要重新用 Word 排版（当然只是听朋友这么一说，未经证实），所以你们这边的书稿只要能正常显示出来就可以了，用什么字体无所谓了，之前我还在想用微软的字体可能会有侵权的问题，现在看来压根不是我们该考虑的问题。

CyrusYip 今天发现 Ubuntu 20.04.3 LTS 即使设置 fontset = ubuntu仍然会报错，报错内容如下：

! Package fontspec Error: The font "AR PL KaitiM GB" cannot be found.

后来在这里的第 9942 行代码发现了真相。代码如下：

\setCJKmainfont { Noto~Serif~CJK~SC } [ ItalicFont = AR~PL~KaitiM~GB ]

参考debian添加中文支持，果断通过安装字体解决问题：

sudo apt install fonts-arphic-gkai00mp

dapengde 关于之前我建议的把 Windows 字体复制到 Ubuntu 下或许是一个愚蠢的建议，我暂时收回这个建议。目前 Linux 系统下 fandol 字体仍然是 ctex 的默认字体，虽然官方也有意将默认字体换为思源字体，但是并不是每个 Linux 发行版都能默认载入思源字体，因此暂时也只能维持现状了。

但是可喜的是，我发现在显式地设置 fontset = ubuntu后，ctex 就会使用 Ubuntu 系统自带的思源宋体（Noto Serif CJK SC）,但同时也得把文鼎字体（AR PL KaitiM GB） 安上。

另，要是 @yihui 能为 Ubuntu 用户开个小灶，当系统缺少文鼎字体时自动安装就更好了（要求是不是有点多了，呵呵）。