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Cloud2016

label: survival (with options)
List of 5
$ fig.width : num 4.8
$ fig.height: num 3.8
$ fig.cap : chr "(ref:fig-survival)"
$ fig.scap : chr "(ref:fig-survival-s)"
$ fig.show : chr "hold"

Quitting from lines 1552-1557 (gallery.Rmd)
Error in loadNamespace(name) : there is no package called 'survminer'
Calls: local ... loadNamespace -> withRestarts -> withOneRestart -> doWithOneRestart
In addition: Warning message:
Could not fit all lines to width 75 (with indent 2):
(90) " mar = pmin(par("mar"), 1.1 + c(2 * axes + (xlab != ""), 2 * axes + (ylab != ""), 1, 0)),"

Execution halted
Error in Rscript_render(f, render_args, render_meta) :
Failed to compile gallery.Rmd
Calls: <Anonymous> ... render_new_session -> tryCatch -> tryCatchList -> Rscript_render
Execution halted

弄了一下午,终于docker拉下来的,不过编译不了。是不是docker里少survminer包啊?

    我来捉虫 😀
    3.1.2 颜色生成和转换函数
    4.28 热图
    4.29 交互效应图
    4.31 生存函数图
    4.40 思考与练习
    5.1.1 几何形状
    ...
    目录的链接似乎有点问题。没有链接到正确的章节。
    似乎有不少。
    Cloud2016

      dapengde 已回复。修订方案可以完全按照你的思路来,把目前我在 Github 上开的 Issues 全部干掉有点不现实,意味着整本书的结构大改。修订方案出来后,你可以在 Github 上开 Issues ,打上第一版的标签。目前稳定版就是今天刚打的 tag 1.4 你可以在现在的 master 分支上改动,也可以在 develop 分支,甚至新建一个 version1 的分支都可以。

      Gujia Jonie_Y Fye 谢谢大家!我们正和出版社商量修订方案,后续应该很快放出来修订计划,计划出来后就撸起袖子开干!

        我倒是觉得ggplot2的资料实在太好找了,实在没必要浪费太多篇幅。

          lovebluesky 这个也看出版社或者作者的意思,总不能让别人买两本书互补吧?一本能全些不是缺点。从出版物角度考虑,当然如果一个人从不买书,只看网上资料,那就另说了

          Cloud2016 现在书稿更新计划,章节部署,谁在拿主意?@pzhaonet吗?

            Jonie_Y 一本百科全书当然好了,我是觉得有取舍,有侧重,这当然需要尊重作者和出版社的意思,尤其是出版社要赚钱,ggplot2 又这么火的前提下。我只是表达一个读者的观点,不希望这本书写太多的 ggplot2,市面关于他的书籍不只一本,或者说近些年关于作图的书,好像都把他作为标准了,再者他网上的资料也有非常多,stackoverflow的提问回答也很全面,我只是想表达一下我的观点,没别的意思,这个帖子不也就是让大家发言的嘛。我这么说也有可能我这样的怀旧心里作怪,不要见怪。

              Cloud2016 大佬啊,你能不能重新打包一下docker镜像啊,我装那些包真的要装疯了。。。还老装不上。。。要不就是缺linux库。

              @lovebluesky 你们怎么能编译这本书的。。。这个编译就是一个大门槛。

                Cloud2016 嗯,多谢,我是不用docker实在是编译不了这本书。有的东西包装都装不上。就因为这本书,才学docker的。。。

                  Cloud2016

                  docker部分的指示能写更详细点吗?我从https://docs.docker.com/compose/install/装了docker, docker-composer
                  搞了半天还是不能编译。

                  WARNING: The PWD variable is not set. Defaulting to a blank string.
                  ERROR: Cannot create container for service book: create .: volume name is too short, names should be at least two alphanumeric characters

                  但是直接编译也会在latex部分出错,连tinytex都救不回来