exile
我的实验是观察一种药物使用后某蛋白不同时间的表达情况,另外各时间段我设置了生理盐水组作为对照。
我的主要目的是了解使用药物后该蛋白的表达有无变化。
请各位指点用什么统计方法好!
药物 生理盐水
time(day) mean SEM mean SEM
0 5.749444 0.2382 0 5.749444 0.2382
0.25 5.641 0.3722 0.25 5.477 0.3309
0.5 5.646 0.4072 0.5 5.272 0.4124
1 5.507 0.4369 1 4.346 0.3781
3 5.648 0.5472 3 4.374 0.367
7 5.698 0.5092 7 4.795 0.3596
14 5.272 0.4852 14 5.109 0.5468
micro@
first, you need to clarify your design in VERY DETAILS.
second, you need to post raw data, not just means and std.err.
W/O all such information, no one can give you a good answer.
netcow
[quote]引用第0楼exile于2006-09-12 02:10发表的“这组数据用什么统计分析方法好?”:
我的实验是观察一种药物使用后某蛋白不同时间的表达情况,另外各时间段我设置了生理盐水组作为对照。
我的主要目的是了解使用药物后该蛋白的表达有无变化。
请各位指点用什么统计方法好!
药物 生理盐水
.......[/quote]
从你的用意上来看你似乎是想了解某干预措施对某个指标有无影响的研究,用来反映蛋白质表达的指标是什么?这个要说明。如果是一个连续性计量性变量,则该实验可以设计为随机区组设计的方查分析的资料获取,则结果可以用两因素的方查分析解决。
都是统计人
很不好意思,一楼的老兄没有在实验前进行系统的统计设计,也许是没有把数据全部写上来吧,但一个完美的实验总要在前期做一个完美的设计!!有时候有必要请一个专业统计人帮助你。
exile
谢谢各位,确实我对统计不太懂,不知道我的设计对不对。我再详细介绍一下
我是用药物注射到大鼠脑内,引起炎症,观测注射药物后不同时间aquaporin4表达情况,了解aquaporin4随炎症的发生和解消的变化。
因为药物是用生理盐水溶解的,所以采取了生理盐水注射作对照,各时间段药物组和生理盐水组均有8只大鼠,另外两组在0时间点共用8只没有注射的大鼠作对照。
我的数据来自western blot图像分析后得到的数据。也就是westernblot做了8次。
我自己现在的做法是生理盐水组和药物组分别用oneway-anova比较,结果生理盐水组内各时间段无显著性差异。药物组1,3,7天有显著性差异。
作图考虑作双折线图。生理盐水组一条,药物组一条。
我这种方法可行吗?
另外,我想请教各位我的试验是否要进行生理盐水组和药物组两组间的比较?生理盐水组是否多余?
micro@
[quote]引用第4楼exile于2006-09-12 19:48发表的“”:
谢谢各位,确实我对统计不太懂,不知道我的设计对不对。我再详细介绍一下
我是用药物注射到大鼠脑内,引起炎症,观测注射药物后不同时间aquaporin4表达情况,了解aquaporin4随炎症的发生和解消的变化。
因为药物是用生理盐水溶解的,所以采取了生理盐水注射作对照,各时间段药物组和生理盐水组均有8只大鼠,另外两组在0时间点共用8只没有注射的大鼠作对照。
我的数据来自western blot图像分析后得到的数据。也就是westernblot做了8次。
我自己现在的做法是生理盐水组和药物组分别用oneway-anova比较,结果生理盐水组内各时间段无显著性差异。药物组1,3,7天有显著性差异。
.......[/quote]
I'm still not quite clear what you did. I guess you are saying you have 104 rats, 8 got absolutely no treatment, 48 got the medicine with 8 at each of the six time point, and the rest 48 got saline only with 8 at each time point? Is this what you trying to say?
anyway, at least two questions are clear now: one way anova is definitely not proper; saline control is absolutely necessary.
exile
楼上的理解是对的,试验动物就是这么分组的。
oneway-anova不正确的话,那到底用什么方法比较呢?还望不吝指教!
exile
其实我也查了很多类似的文章,好像方法都不太一致,我这种情况用得多的是dunnett法。这篇文章中就有和我类似的地方,就是看不懂它到底是怎么比较的,是各时间点试验组和 对应的pbs比较吗,好像这样又不是dunnett,因为dunnett是多个实验组和同一对照组比较。谁能解释一下下图是怎么比较的吗?
冀京四海
个人同意2楼的意见,应该是双因素方差分析
micro@
[quote]引用第8楼冀京四海于2006-09-15 00:09发表的“”:
个人同意2楼的意见,应该是双因素方差分析[/quote]
Not necessarily. Up to now, I might (not sure since I didn't _carefully_ read the posts yet) agree with a model corresponding to a two-way design. But this does NOT mean two-way anova! But two-way anova might be a reasonable "first try" to see if it fits or not.
dunnet procedure is not a MODEL. Make sure the model is right before thinking about multiple testings.
micro@
A somewhat closer look at the treatment data indicates, at least to me, that the standard error depends on the time, which is a BAD property that might discourage the use of ANOVA. Hence, as I said, I agree with a two-way type design for this problem, but not necessarily two-way ANOVA. But, I don't have raw data, and I'd like to see some plots on the externally studentized residuals to give more suggestions.
nwsuaf
对,明显不适合用one- way ANOVA.
ifeelyou
个人意见:
1。楼主你说做图形分析,这个只能是作为参考,不是严格的分析,严格的需要做统计检验;
2。生理盐水组当然必要,对照原则是试验的基本原则之一;
3。如果我没有理解错你的试验设计的话,你这个是有重复测量的多因素设计吧,至少有两因素,一个是你的处理因素,一个是时间,所以这个应该用多因素的方差分析,这样还可以考虑交互作用,而不是用One-Way-ANOVA。
另外,你还是没有把你的试验设计没有讲解清楚:
比方,到底是随机分组呢还是配对设计或者是配伍组设计呢?
其实统计分析并不是独立的,试验设计也不是单独的;应该是试验设计应该贯穿统计方法,统计分析要先熟悉试验设计。
saihuatuo
不看设计,单从数据来看,属于重复测量数据,不能用One-Way-ANOVA。应该采用重复测量数据的统计方法,SPSS和STATA等软件均可以实现。
同意楼上的,实验设计比统计更重要,首先要清楚自己的设计!
kanedong
You may try Time Series method to get autocovarianve and autocorrelation.
greenpine
rtist
[quote]引用第14楼kanedong于2006-12-14 11:29发表的“”:
You may try Time Series method to get autocovarianve and autocorrelation.[/quote]
impractical for this data set.
chyshl
同意13楼的看法。总得来说应该使用方差分析方法,但不是双因素方差分析。在一个个体上以不同时间点重复测量同一指标,明显应归于重复测量数据的方差分析,因为同一个体的不同次测量之间不是独立事件,而是有相关性的。但实际应用起来,上述两种方法的计算结果应该相差不大。
rtist
这个问题不要再讨论了,楼主自己都不回来把问题说清,我们还在这儿瞎嚷嚷什么?
btw:并不是有时间因素就是重复测量数据,楼主根本没说清是不是。
exile
[quote]引用第18楼rtist于2006-12-30 17:49发表的“”:
这个问题不要再讨论了,楼主自己都不回来把问题说清,我们还在这儿瞎嚷嚷什么?
btw:并不是有时间因素就是重复测量数据,楼主根本没说清是不是。[/quote]
很久没有来了,当时在这里发帖很希望得到帮助,可惜关注的人不多,等了一段时间就走了。
后来我请教了别人,分别对实验组和生理盐水组各个时间段进行了dunnett比较,因为我的实验中生理盐水组各个时间段和空白组对比并无明显变化,所以没有对实验组和生理盐水组进行比较。
另外正如楼上所言,我的试验并不是重复测量,各个时间段的样本是独立的。
谢谢各位!
有点好奇的是,各位是什么专业吗?