[s:14]多谢各位指教

回复 第2楼 的 nan.xiao:规模大势必R速度会变慢,有专门画社群图的免费软件吗?推荐个呗~

我了解的很少 。。。

规模大了以后不仅仅是速度慢的问题 布局方式更是一个问题 。。。

我只知道规模大了以后可以用环形布局 比如Martin Krzywinski开发的circos

还有一种线性布局的叫hive plot 最开始出了个原型软件包叫linnet 现在好像没了

以上都是perl写的 用户需要通过写配置文件来画图 略恶心 。。。

不过速度还可以接受

有人在2011年12月在CRAN上为hive plot推出了R包

名为 HiveR

可以一试

4 个月 后

用R的igraph, 也试过Gephi,挺好玩的。lz不妨试试。

回复 第5楼 的 nan.xiao:

学习!

另外, Cytoscape 在生物/化学领域用得比较多,自带了很多插件和布局。

但是图不是很漂亮。