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  • 请问如何用ggplot画出曲线簇？

yihui 我在学校的几年，基本把图书馆关于 R 的书，浏览了个遍，比较全面细致地去教人如何画图的几乎没有，它们看起来都是镜面反射，没有一点新意，唯独对《“古”代统计图形》抱有很大期待，相比于其它书籍，这本书的优势是追根溯源，用词考究，关于 Base R 的特别全面，这对于那些要往期刊上发文章的，是特别好的作图参考材料，特别好的参数查询手册，近些年，关于 Base R 的另外一本好书是 Thomas Rahlf 的 《Data Visualisation with R》相应的网站 <http://www.datavisualisation-r.com/>，别的就没见着了

我本想把多年沤在书签和硬盘里的东西整理出来，其实有段时间也确实在整理，见 RGraphics，后来又想到这对于当下的我，可能不是重点，就没继续整理，而且我也没有在统计图形里深入研究过，不太可能写的比谢大还好，目前它变成了个分类器，除了数据处理、 ggplot2 和案例，也没多少兴趣继续，索性搁置了！

    最近，我买了两本中文技术书，一本是《统计学习方法》第二版，一本是《深度学习》中译本，前者是自己一个人在写，后者是开源在 Github 上，一大群人在翻译。蹭热度没什么不好，但是为了赶时间降低质量就不能理解了，最讨厌写书也走敏捷开发的路子，带坏风气，如果一个人时间精力不够，质量把控不过来，就号召一群人来把控呀，我觉得这两本书在质量上现在形成鲜明的对比。我是那种不喜欢追时髦的人，特别是技术书和教材，我偏向于沉淀下来的经典著作（这一点是我导师带给我的影响，研究生阶段主要在啃十余年以前的专著，所以我看到书里的用词，就特别去思考，实在忍不住就在票圈里吐槽）。

    最后，总结一下，写书追求完美没什么不好，总比误人子弟好！如果精力不够就开源出来，一群人的眼睛盯着质量总比一个人赶工期好的多！谢大的书是不出版，放个样张也造福大众，绝对是个异数。

      yihui
      于是出版社少了一本神作，江湖上多了一个传说。

      浏览了一遍，内容（对统计图形的介绍）和文笔都是上品，能潜心看下去的读者定会受益匪浅。只是在哥哥作图如日中天的现在，基础 R 图形代码可能对一些人来说略“不合时宜”。

      3.7 图例首句有个别字。

          Cloud2016 好，我尽快抽空开源出来，但我的源文档是 LyX 写的。你四个月前的回帖我还放在我的浏览器里没关：https://d.cosx.org/d/420476/26 就等着你们把它转成 bookdown 了，估计有不少技术难点。

          Liechi 时隔这么久，我自己都不敢看了。文风里有不少稚气和卖弄的成分，而且内容上我怕我看了会无限挑刺。

                1 个月 后
                5 天 后

                Cloud2016 最近没有时间做这个事情，虽然我很想看到古代图形统计早日重见天日。我对用 github 工作很不熟悉，所以在开始搬砖前需要从一些比较基本的东西学起，但是最近没有精力去折腾 github。

                你可以发个帖子召唤点忍者来帮忙。如果我对要做的事情上手些了，也会来搭把手。

                    Cloud2016 好的，我加入。谢谢邀请！

                    有三个问题或建议：

                    1. 这个项目的目标，是不是只需把书稿从 lyx 格式迁移到 bookdown 格式，一字不改，而后续的修订全是 @yihui 的工作？
                    2. 我觉得事先分一下工比较好，免得两个人或几个人不约而同做了同一件事，一磨叽，冲突了。
                    3. lyx 我几乎没用过，如果有任何迁移的经验，哪怕是最基础的，希望分享一下，避免时间上不必要的浪费。

                    Liechi 我觉得不必对 git 望而生畏，也没必要事先专门系统学习。边用边学效果好，以赛代练效率高。你可以拿 TNT 擂台赛练手，打碎不用你赔。

                          yihui 你想怎么折腾就怎么折腾吧。我感觉这会是严酷的体力活儿。

                          dapengde 根据谢大的指示，我觉得我们有相当大的自主权，

                          1. 首先尽量搬迁，如果有难以重现的可以暂不搬迁，在相关地方注明即可，我希望能在 R Markdown 中运行的就在里面运行，比如生成图形和模型计算，如果有耗时长的操作，可以不运行，贴结果
                          2. 要不我来序言、第1、3、5、7章，附录 A、C，你来2、4、6章，附录 B、D，如果有人加入，再从你我的章节中各分一些给他
                          3. 首先下载安装 LyX 我选了就近的站点 <https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/lyx/bin/2.3.3/> 下载，然后用它打开 Modern-Stat-Graphics.lyx 或者依据 Modern-Stat-Graphics.tex 文件复制文字（我没找到更方便的转化方式），把文字复制出来后，再在相应的地方以 R Markdown 的方式把 R 代码块和图片插入
                          4. 我已经加你为项目合作者，你要接受一下，然后可以直接推动修改到仓库了
                          5. 由代码自动生成的图片，暂不调长宽比等格式，首先尽量把内容复现就好
                          6. 参考文献和章节的引用可以暂时不搞，先解决图、表的交叉引用

                                dapengde
                                以赛代练是好主意，只是开始的阻力较大，我对 git 的了解，仅限于用它推过文章；用它做别的事情，感觉无从着手。你知道有什么材料适于新手学习吗？

                                    Liechi dapengde fork commit push merge 会这些基本就够了。如果再遇到什么其它的操作可以参考这个查询手册 <https://github.com/521xueweihan/git-tips> 然后就是放狗搜，最后就是拿出来问，比如我以前问的 <https://d.cosx.org/d/420426>

                                    Liechi 如果真的那么惧怕 Git 不妨先 fork 这个项目，然后在自己 fork 的项目里修改, RStudio 里提交 commit，推送到 Github 后，手动提交 PR。大多数情况下，我也是在 RStudio 里弄

                                            Cloud2016

                                            好的。可以在 readme 里列个任务分配表，把正在做的标识出来，剩下的任人认领。这个表我可以做。

                                            你的邀请邮件我收到了，然而点了之后进去的不是 /invitations 页面，所以没法接受邀请。

                                                dapengde 看来这个是我单方面决定的，从设置里可以看到，你已经在合作者列表里了

                                                好啊，你来加任务分配表

                                                    Cloud2016

                                                    然后用它打开 Modern-Stat-Graphics.lyx 或者依据 Modern-Stat-Graphics.tex 文件复制文字（我没找到更方便的转化方式），把文字复制出来后，再在相应的地方以 R Markdown 的方式把 R 代码块和图片插入。

                                                    我用了一个稍微省事的办法：先用 pandoc 把 tex 文件转成 markdown，再把后者拷贝粘贴进 .Rmd文件。

                                                    pandoc 转换全书的话出错。我就只转了第 2 章，尚可。只是代码部分全丢失了，需要从 lyx 文件里手动拷贝粘贴。不过这样也有好处，就是顺便把 sweave 的图片选项也拷进了 .Rmd 的 chunk 选项里，最大程度保持跟原稿的一致。

                                                        Cloud2016 关于图、表、章节的交叉引用，我们可否做如下约定？即

                                                        1. 沿用原稿的图表标签 (label) 不变，除非原稿有错误。
                                                        2. 在章节标题后面添加标签，与原稿标签一致。

                                                        这样的好处是，跨章节的交叉引用只需大体过一遍就基本不用改了——虽然后面的章节还没搬过来，暂时会显示为问号。

                                                            dapengde 我就是这么干的，除非图、表的引用有问题，比如我看到图的 chunck option 里有这样的标签heart_curve 我就把它改为 heart-curve 。

                                                            至于文中还没有说明需要哪些 R 包，我们暂不添加类似安装 R 包的代码

                                                            if(!require('MSG')) install.packages('MSG') # 安装本书配套的MSG包

                                                            一方面是我打包镜像的时候几乎把所有需要的 R 包都打包了，如果本地缺的话，就自己安装下。

                                                            另一方面是我觉得 @yihui 有必要在合适的地方添加一小节说明本书用了哪些 R 包，至少提供 xfun::session_info(pkgs)，这是他的一贯做法，我也比较喜欢这种方式。或者告诉读者怎么获取和使用我打包的镜像文件，以及如何在容器中编译书籍，这个过程其实我公开了，目前，我让 Travis 就是这么干的。基本上不用操心依赖问题，我来操心就好了！