一个老问题再拿出来问一下
因为最近想把单样本,多样本比较整理一下,关于这个问题,想再请教一下各位
我有一列基因在两个样本的表达量:
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Gene S1 S2<br />
ART4 4.92143 2.89385<br />
AZGP1 3.87462 3.86413<br />
C20orf103 3.38678 3.451<br />
C3 3.85766 3.66852<br />
C7orf16 4.01758 4.49015<br />
CDH5 6.68535 3.90784<br />
CPM 3.57492 4.26991<br />
CYP4X1 3.45229 3.59845<br />
DDX3Y 7.3952 7.60647<br />
EDNRB 6.1241 3.27362<br />
EIF1AY 8.79199 8.71892<br />
ELTD1 6.90271 4.9844<br />
GABRA2 4.28023 3.57325<br />
GABRP 6.74015 4.95259<br />
GDF3 3.1609 3.38629<br />
GLIPR1 5.21847 3.50253<br />
GPR50 3.93796 3.66198<br />
HIST1H2BB 4.10468 4.1237<br />
HPSE 3.67252 3.93885</p>
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</p>
我想找出哪些基因在S1和S2之间是有显著差异的
t-test 好像只能给出两组数总的pvalue, 如果我想得到每个基因在s1和s2之间的pvalue, 应该用什么test
如果s1 和s2 有重复,我知道怎么做,但是对于这种没有重复的两个样本比较,除了找fold-change, 统计学上还有什么合适的test吗。。。
Thanks a lot!