我用的 hugo-ivy 主题，我这边是在 /layouts/partials 目录下的 foot_custom.html 文件中加入了如下两行代码：
<script src="//yihui.name/js/math-code.js"></script>
<script async src="//cdn.bootcss.com/mathjax/2.7.1/MathJax.js?config=TeX-MML-AM_CHTML"></script>
当然，你的博客的文档结构可能和我的有所不同，供参考。
另外，你可以考虑把 “math-code.js” 文件放在 static 文件夹下。比如放在了 static/js/math-code.js,那么上面的路径相应的改为 <script src="/js/math-code.js"></script> 即可。
