knitr与可重复的统计研究（花絮篇）

COSeditor

https://cos.name/2012/06/reproducible-research-with-knitr/

cloud_wei

真想去今年的useR会议上围观knitr:) 话说knitr和ggplot2啥时候能成为R的默认安装包呢？

ypchen

好久没听到谢老大的声音了激动ing~~
料想knitr包在未来必将改变科研作者的生产方式

ruikoeln

很赞！刚刚学会了一点sweave，马上转到knitre似乎还有点犹豫。老大的这个包已经开发完毕了么？我来诉个苦，sweave.sty这个文件把我折磨的够呛，最终还是通过R, library(tools), tex2pdf()绕过去的。以后就用老大的包了。

yihui

不可能。因为这两个包都有一长串依赖，R core必然不愿意维护所有这些依赖，而且我看现在进R core比登天还难。

yihui

这就是我说的“即使不清楚也没关系”的问题，Sweave.sty不知道害了多少人，因为它在R的安装目录下，并不是一个CTAN上能找到的LaTeX包，用户往往不知道上哪儿找以及怎么配置，所以对knitr来说，所有依赖的LaTeX包会首先被检查一下，如果能找到，就用系统已存在的包，否则knitr会拷一份过来供LaTeX使用，你永远都不必担心LaTeX包找不到的问题。

这包都已经发布半年啦，主要功能早就开发完了，只不过对国内用户我还没太宣传而已。knitr兼容Sweave，所以不需要犹豫，对RStudio来说只是换个选项的问题。

王盛曦

（上面一条邮箱填错了。。。。）原来谢大的声音是这么有磁性：）。knitr确实很方便，很适合我这样的懒人啊~

yconglian

果断不学Sweave，直接跳入knitr世界O(∩_∩)O~

yihui

晕死，哪里磁了……

王盛曦

本来想象中是那种很粗犷的声音，没想到。。。还是很温柔的。

paradoxbirdy

后知后觉也有用武之地～

Cindy-qingxia.chen

有幸在useR 2012上听到你的报告，讲的很好，其中穿插的冷笑话很是调动大家的情绪。

yihui

谢谢，这次会议在笑话方面有点超常发挥，嘿嘿，也很高兴认识你们

wyfwps

您好！我用RStudio，如果选择sweave选项中的LaTeX editing and compilation选项下的多个选项就会出现Error running C:/CTEX/MiKTeX/miktex/bin/pdflatex.exe (exit code 1)错误。如果只选择第一项Clean auxiliary output after compile就没有问题。请问这是肿么回事呢？谢谢！

yihui

Windows的问题对我来说不方便考证，我只有遇到大问题的时候才到Windows下去测试。对这个问题，你一定需要下面的那些选项吗？

wyfwps

那倒是不需要，只是有一次我选上了之后就出问题了，想问问您。谢谢您的回复。

mathcying

感觉knitr这类工具对个人研究有很大帮助, 对大规模的研究项目, 研究任务的分工协作以及不同研究阶段的工作成果分享可能支持不够.

yihui

这不是knitr的事情了，knitr只是基础设施，你提的这些问题都是好问题，但我觉得更多是教育的问题，仅靠软件很难解决。

cionysus

请教一个opencpu的问题。
我可以把自己本地的数据加载到opencpu中进行处理吗？
我直接用load('/home/usr/Documents/data.rda')，网站说有错误。

yihui

你可以上传到他的服务器上。直接加载本地的数据当然不会成功，因为服务器上不存在/home/usr/Documents/data.rda。参见其API：
http://public.opencpu.org/pages/docs.html （你应该可以注册用户之后放在你的用户目录下，也可以不注册，放在临时文件夹下，我已经有阵子没看文档了）