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  • 2010年8月3日
  • 注册于 2007年8月29日
  • 我用irr包中的icc命令后,我想把我结果中的icc值,也就是-0.0664提取出来,用了一下result$icc,不是,但是p值可以这么弄result$p,那我应该用什么其他命令呢,谢谢各位

    >result<-icc(cbind(combatexpdata_p[1:62],combatexpdata_p[63:124],combatexpdata_p[125:186]), "twoway")

    >result

    Single Score Intraclass Correlation

    Model: twoway

    Type : consistency

    Subjects = 62

    Raters = 3

    ICC(C,1) = -0.0664

    F-Test, H0: r0 = 0 ; H1: r0 > 0

    F(61,122) = 0.813 , p = 0.814

    95%-Confidence Interval for ICC Population Values:

    -0.184 < ICC < 0.086

  • 一个很初级的问题

    对于一个plot上分布的点,如何画出一条直线,或者曲线,拟合这些点的分布,直线的话怎么进一步知道斜率,截距等信息。 曲线的话又没有可能得到这个方程?

    另外一个问题是怎么充分利用R的help,我一直听说这个东西很好用,但我自己在查的时候不得法,如果我能用得好一点,就不会问出上面这种让人一看就觉得你应该去看R的manual的问题了

    谢谢各位

  • 回复 第2楼 的 yanlinlin82:

    不是行号,就是本来是

    sample A1 A2 A3

    gene1 4.5 6.4 4.1

    gene2 7.8 6.8 3.9

    再写入的时候就变成了

    A1 A2 A3

    gene1 4.5 6.4 4.1

    gene2 7.8 6.8 3.9

    我现在是用的

    data1 = cbind(ProbeID=rownames(dataMatrix), dataMatrix)

    write.table(data1, file=’test.txt’, sep=’\t’, row.names=F)

    这样先去掉row.names再从原数据中读出来,我不知道你说的row.names的参数是不是就这样把它去掉就可以了

  • 在读文件read.table时header=TRUE,row.name=1然后data处理过之后再write.table的时候,生成的文件没有了原来file的左上第一个column的信息,就是header错位了一行,不知道大家怎么解决的。。。

  • 多谢多谢,如果说网页设计的话,个人认为黑色过于庄严了。。。仅供参考~