这个要用配对数据ttets
回复 第6楼 的 Tracy X:加大访问量 还是要的
回复 第4楼 的 lyxmoo:回复 第4楼 的 lyxmoo:目的是为了加大回帖数目,论坛还是人多点好!
概率与数理统计学好就ok了
比例差异的检验 可以用 列联表 卡方检验
统计出所有样本的测到的甲基化位点,材料间有这个甲基化位点的读1,没有这个甲基化位点的读0,然后进行聚类分析。
如在你所有材料测得甲基化位点有如 chr1 68 100 1121 1621 2000 2500
那么 第一个样则为 chr1 0 1 1 1 0 0
第二个样 则为 chr1 1 0 0 0 1 1
然后用NTsys 或者其他聚类分析个人认为,[s:14]差值的大小与检验统计量的显著不显著是两码事。
大概3-4年之前注册的统计之都的帐号。可能是由于学习的需要,发了一些关于软件应用以及统计方法的帖子,虽然问题简单,但是论坛里面不少朋友都热心回复,给了不少帮助,回帖也比较快,可能是因为那时论坛板块还没有那么多,也没有版主。老谢建立维护这个网站,完全是处于热情,并无分文报酬,能到今天,实在不易。在以后的时间,也偶尔上过,但是好几次都打不开网页,我一直以为cos从此没了,后来一直没有上,于是混迹小木虫,直至版主。今天打开我的雅虎邮箱,发现有老谢的邮件,加起来也有不少封了,于是打开其中一封,上了cos,能上,不过网速不快,较之3年之前,不过是在版面还是人员上都有很大的进步,几乎靠老谢等一己之力能发展成这样,不容易,很是感慨!
不过,作为受过cos好处的一员,给论坛提点意见
1 论坛没有回帖奖励措施,比如金币等
2 没有版主手册,规定,版主的权利以及义务
3 各个学科中都要用到统计,应该还有很大的挖掘空间用Excel的功能,分区间,后统计数目,最后画散点图。
连锁分析和关联分析各有优缺点,目前有人把两种方式结合起来:nested association mapping (巢式关联分析。)
人类中不能够用作物中的连锁分析,不过在那里,你不可能随便拿人做F2等群体http://baike.baidu.com/view/2968102.htm
- [quote]引用第16楼hexm26于2008-12-03 10:02发表的“”:
试验目的:研究普通拟南芥和发生突变的拟南芥在某个激素的诱导下的是否有差异,数据表现为基因表达强度是否有统计上的显著差异(P值小于0.05)。
试验设计:6株拟南芥,其中3株为普通拟南芥,而另外3株为发生突变的拟南芥。每株拟南芥的基因表达强度分别在某个激素的诱导下后的1,2,3,4和5个小时以后记录。试验假定,如果没有某个激素的诱导,发生突变的拟南芥在发生突变之前和普通拟南芥的基因表达强度是没有统计上的显著差异。
试验数据:所有数据都以四舍五入后的整数表达。没有数据遗失情况。
.......[/quote]
thanks very much - 于 四川大学顶起撒!
- [quote]引用第1楼friend于2008-05-18 00:30发表的“”:
统计学方法可以决绝楼猪的问题么?!看来实在不才,看都没看懂。[/quote]
楼主所用的软件是基于统计学方法的,只不过模型是自己建立的而后应用到软件中去的 - [quote]引用第2楼bleat192于2008-05-18 11:20发表的“”:
奇怪的是基因贡献率这个东西应该是有个什么定义的吧[/quote]
就是该QTL(数量性状位点)位点解释多少表性变异! - 楼主的问题是具体到你用的QTL作图软件,可以到软件介绍里看到·
- 我觉得也许有的时候用眼睛看,用笔算,也许得出的结果要比统计软件要合理得多。
- 于 四川大学[quote]引用第2楼ypchen于2006-06-21 12:05发表的“”:
终于有川大的人来了 川大的数学很强的[/quote]
佛教比数学强多了,谈起数学时是问数学在国内排第几,谈起佛教时就问世界排第几,这个不是同一数量级的。支持川大 - 于 四川大学[quote]引用第8楼aqin6-9于2006-08-28 13:00发表的“”:
曾经的川大人 2005年本科华西毕业[/quote]
刚合并的时候,华西的学生从来不说自己是川大的,不过华西在没有合并到川大之前,比以前的四川联合大学强多了,现在合并了华西,川大也强多了,排名也提高了很多,还是不错的。 - [quote]引用第14楼hexm26于2008-11-30 11:04发表的“”:
很好,有你对试验的这些解释就足够了。
如果我将数据修改如下,你觉得可以吗?:
诱导时间(h)
.......[/quote]
您好!
0时刻是指诱导0小时,相当于不诱导,不能把它作为诱导的产量。本数据分析的处理是突变与不突变,不是考查激素对植株的诱导能力。我个人认为,如果要研究激素对这两类植株的诱导的效应大小,必须要考虑0时刻的本底表达量也就是基线。而本研究是与此不同的,可以不考虑,而同时由于本基因只有在激素的诱导下才能表达,所以分析数据的前提是必须先保证它得到了充分的诱导,得到充分的表达,诱导只是一个手段(一般1到2小时),而不同的是我却多测了几个延长诱导时间的数据。
还是举兴奋剂的例子,我们必须要让两个同卵双胞胎在竭尽全力的情况下跑100米,使其能力得到全部的发挥,这样才能达到考查兴奋剂对100米赛跑的作用。如果他们两个没有尽全力,或者缓慢的跑。那就不能达到研究的目的。
谢谢!