luansheng

回复 第4楼 的 bemyselfcc：应该是你说的原因。

回复 第1楼 的 cloud wei：

1.听过ggplot2吗？是否熟悉？

最近听说，正在使用。目前已经用knitr+ggplot2正在写一个自动化程序，实现自动输出育种数据分析报告。

2.经常用吗？从哪里获取相关知识？

正在用，中文资源少。主要是从网上，英文资料获得。急需一本中文教程。

3.对ggplot2的感觉、评价如何？是否准备进一步学习ggplot2？

ggplot2画图的图很漂亮。准备深入的学习，想画出可以符合学术论文出版规范的图。

问题已经解决：需要在一开始就用行内代码.

我现在遇到的问题是如何生成模版中chunk的名字，如果模版的名字不变，那么图片的名字都会相同。因此运行后，画出的图都是最后一副图。

刚才察看了 \Sexpr{}是行内代码.直接写为rmd中对应的行内代码就可以了。

现在是Rsutdio的天下了。变化真快！

哪位高手愿意把这段rnw代码帮我翻译成rmd代码？我latex不懂，非常谢谢！

<br />
\section{Now i is \Sexpr{i}}</p>
<p>\Sexpr{''}<<\Sexpr{paste('arbitrary-chunk-label-', i, '-here', sep = '')}>>=</p>
<p>print (\Sexpr{i})<br />
iris[\Sexpr{i}, ]<br />
boxplot (iris[, \Sexpr{i}] ~ iris$Species)<br />
@<br />

回复 第5楼 的 谢益辉：我是病急乱投医啊，[s:12]我改。

还是遇到了问题。由于图的label中有中文，通过knitr编译会有很多warning，影响速度，上次您给了一段代码：

options(device = function(file, width, height, ...) {

png(tempfile(), width = width, height = height, units = 'in', res = 600, ...)

})

加入这段代码后，不会出现warning了。

按照您给的例子，加入如下代码调节图形大小：

fig.width=convertWidth(unit(nlevels(Generation)*9.6,"inches"),"inches",valueOnly=TRUE)

会出现错误提示

“geometry(width, height, units, res): 缺少参数"width",也没有缺省值”

删除options设置那段代码就好了

第二个问题：如何将fig.width=convertWidth(unit(nlevels(Generation)**9.6,"inches"),"inches",valueOnly=TRUE)嵌入R代码循环中？

在每个循环中个，generation的level数都是变化的。我需要根据每个循环产生的level数设置图形大小。

已经看了，解决大问题了！感谢！

正在用谢益辉大人的knitr，结合ggplot2写自动化输出图片的程序。现在遇到这样一个问题。一般的做法是，在chunk中利用fig.width，fig.height提前设置输出图的大小

我遇到的问题是：如果利用ggplot2中的facet_wrap函数，可以一次输出多个子图形。但是当输出的子图形数量过多时，根据提前设置好的fig.width，fig.height输出的图中，每个子图就会很小，甚至看不清楚。

我现在的想法是，提前判断生成的图中包含多少个子图，然后动态调整输出图的大小。

但是不知道该如何做，还请各位高手指点。谢谢！

回复 第5楼 的 gaolei：谢谢您的指点。我明白了。

回复 第2楼 的 肖楠：肖版，怎么加capttion还请您给示范一下，谢谢！

print(ggplot(data=AnimalNumperFullSibFamily,aes(x=FamilyID,y=AnimalNum))+geom_bar(stat="identity")+labs(title=paste("图",FigNum," ",SpeciesName,names(FamilySummary)[j],"数据集","测试家系的家系内测试个体数柱状图",sep=""),x="家系编号",y="个体数")+theme(axis.text.x=element_text(angle=90)))

回复 第5楼 的 王晓伟：windows 下也可以，需要下载python。很好用！强烈推荐！

试一下Vim-R-plugin : Plugin to work with R 插件吧。

试用了一下，非常棒。完全实现了在VIM下调用R，几乎实现了tinn-r的所有功能。不知道为什么，这么好的一个插件，大家都没有发现。详细请看安装说明。

地址：

http://www.vim.org/scripts/script.php?script_id=2628

正是我需要的。对于理解REML太重要了。建议楼主继续系列文章。