darnassas
一些基因之间的表达相关系数(共有n个元素,n>600),这n个元素中符合条件A的有m个元素(m>35)。
根据m个元素的均值大于n个元素的均值是否可以说明处在条件A下的相关系数比总体大?
如果不能,想比较这m个元素与n个元素的差异应该用什么样假设检验?
请大家赐教
w231371930
我想做fisher exact test,基因检测和基因型检测
但不知道应该将等位基因频率转换成什么数据才能进行检验?
应该查阅什么文献呢,我在网上找了好久都没有相关的例子
能帮助我吗
谢谢
rtist
Fisher's test is critically dependent on independence assumption, which is not appropriate here.
rtist
given the information we have, I don't think it is possible to do any formal tests here.
but if you have all the raw data, e.g. the data you used to calculate gene correlations, there might be sth to be done in that case, depending on the design.
darnassas
我想探究的目的是:符合条件A的基因对是否更倾向于协同表达。
n对基因中(对应于n个表达相关系数)符合条件A的有m对基因(对应于m个相关系数),我上面问的第一个问题是:如果m的均值大于n的均值,而且m中相关系数大于0的比例也大于n中大于0的比例,是否可以下这样的结论:处于条件A下的基因更倾向于正相关?
我有计算出基因对相关系数的所有原始数据,怎样比较才能实现以上的研究目的或者怎样比较可以得到一些有意思的结论?
请rtist指教,也请大家指教
losttemple
2种属性,属性1:是是否符合条件a,属性2:是否协同表达
问两种属性是否相关,可以这样理解吗?
rtist
Is this a microarray data?
darnassas
我关注的是符合条件A的基因有什么样的特征
所用的芯片数据是从网上下载的