示例
有多个数据集，其各自包含多个成对数据（为了说明的简洁，这里都以两次重复为例）：
数据集X：a1 a2，b1 b2
数据集Y：c1 c2，d1 d2
现在需要计算一个能代表所有成对数据1/2的组内差异的统计量。
（这里成对数据中虽然写作1或2，但其实是等价的没有区别，只是为了便于表达）
自己的理解
如果只针对数据集X的话，因为只有一个因素小写字母，所以可以使用单因素方差分析来分解出成对数据的组内差异。
但现在多引入了一个因素数据集大写字母，且并非满秩的设计，这使得数据形式变成了：
Xa1 Xa2，Xb1 Xb2，Yc1 Yc2，Yd1 Yd2
的形式，这样一来似乎没有办法简单的套用多因素方差分析了。
提问
请问大家这种非满秩多因素配对数据的组内差异该如何计算？
或者有什么其他思路可以计算一个能反映组内差异的统计量？
