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  • RTCGAToolbox 包下载 TCGA 数据出错

各位大神好!自己在学习用RTCGAToolbox下载TCGA数据时,遇到报错,报错如下:

          Error in file.rename(from = fileList, to = destfile) : 
  expanded 'from' name too long

以下是我输入的代码:

source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("RTCGAToolbox")
library(RTCGAToolbox)
length.MArrayLM = function(x) prod(dim(x))
getFirehoseDatasets()
getFirehoseRunningDates()
getFirehoseRunningDates(last = 2)
Data=getFirehoseData(dataset = "BRCA",runDate = "20140115",clinical = TRUE,
                     RNASeqGene = TRUE,mRNAArray = TRUE,Mutation = TRUE)

不知道问题出在哪里了,恳求大神指教,谢谢!?

    5 天 后

    lubingjun 同学,可以看一下提问的规范。清晰,明了的标题可能让更多人来帮助你。

      Cloud2016 更改标题为「RTCGAToolbox 包下载 TCGA 数据出错