wqssf 小生在做微生物lefse分析,本打算用在线分析工具分析,但数据上传过后,一直进行不了分析! 因此,在这里问一下老师们,R语言有现成的包做lefse分析吗? 我根据lefse分析原理,用R来一步一步分析,但只分析到判别分析这步,后面的进化分枝树不知道怎么画?也不确定前面的判别分析分析是否正确。望老师们提供帮助。
tctcab wqssf 搜了一圈,有个lefse的包,不过从这个google group的讨论看只是重名而已 再仔细看了下文档,发现lefse有本地版,可以homebrew安装或者源代码安装,有用python写的,参见lefse在bitbucket上的官方repo, 建议试一试本地版