在横向蛋白质聚类的树状图和列向样品聚类的树状图中,如何在横向根据分组情况显示不同的颜色,以表示蛋白质的聚类?列向可以用heatmap等函数实现一种颜色表示一个组的目的。
回复 第1楼 的 fanshijie7157:RowSideColors参数。颜色由聚类的类别映射。
问题解决了,谢谢你。另外,想问下,再用heatmap.2绘制热图时,哪个参数可以改变热图每个网格的大小呢,我尝试了几个都没能解决这个问题。
回复 第3楼 的 fanshijie7157:建议用 pheatmap,可以控制。
我用pheatmap实现过,但是因为要在行和列上都显示聚类分组的颜色,所以目前只知道用heatmap.2可以实现此目的,在此基础上又希望调整网格的大小,这个如何做到呢?
回复 第5楼 的 fanshijie7157: 那就用 aheatmap, NMF 包里面的函数。
你说的aheatmap使用类似于pheatmap的使用,我没办法获得行上的聚类分组的颜色。
回复 第7楼 的 fanshijie7157: 肯定是可以的,再好好研究一下帮助文档和例子吧。