如果更快速获取逻辑判断结果

fanchong

这边有一个染色体基因position的向量，向量非常长，而且每个向量元素肯定是逐次增大的，标识着基因的位置

需要做一个滑动窗口（比如100k），不断扑捉窗口内的基因位置信息，从而再提取其他信息

突然想到，由原向量做前后窗口位置的判断，得到的逻辑向量是非常长的，而且又由于原向量元素大小严格排列，对于这种问题可以有什么办法省一下计算资源么

yanlinlin82

回复第1楼的 fanchong：

1. 不太理解你说的“捕捉窗口内的基因位置信息，从而再提取其他信息”是在做什么。如果某个滑动窗口内没有任何基因或者有很多基因，你分别打算怎么处理？

2. 如果你的问题是想节省计算资源，你可以把你的不够节省计算资源的代码或伪代码给出来，帮助大家理解你的目标；

3. 如果你是在用R，推荐使用Bioconductor中的GenomicRanges。