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我的资料中有7种等位基因,已经分别计算出病例对照组中各等位基因的频率,用卡方比较了各等位基因在两组间的差异,有意义.想进一步明确到底是哪一种等位基因在两组见存在差异,具体该怎么做啊?比如:等位基因 病例 对照 卡方值 P值
A1 316 205 0.111 0.739
A2 96 25 6.014 0.010
A3 12 10 0.296 0.586
A4 50 31 0.333 0.564
A5 35 31 1.502 0.220
A6 25 13 0.522 0.470
A7 71 43 0.241 0.623
Ax 12 10 0.292 0.589
总研究例数497,病例组299,对照198,以上数据中为染色体数.请教卡方值是如何算出来的啊?请哪位高手赐教.谢谢.
shoeda
建议你使用原始数据通过交叉分析得到等位基因分类和研究组别的频数交叉表,并且得到卡方统计量,先从整体上比较不同的等位基因见是否存在差异,再通过非参数分析的配对样本检验进行两两检验(SPSS中需要自己定义检验组,比较麻烦。)
w231371930
我想做fisher exact test,基因检测和基因型检测
但不知道应该将等位基因频率转换成什么数据才能进行检验?
应该查阅什么文献呢,我在网上找了好久都没有相关的例子
能帮助我吗
谢谢