bleat192
各位大侠好，本人做水稻qtl定位的，在很多qtl定位的文献中都见到有说某某性状的qtl定位到某某染色体上某些标记之间，然后就说该位点的贡献率是多少。（英文文献上例如qES3 increases about 20% of the frequency of the exserted stigmas at the IR24 allele and explains about 32% of the total phenotypic variance.）本人使用joinmap构建连锁图谱，WinQTLCart 2.0 定位qtl。可是只看见有加性效应和显性效应的曲线图，不知道哪里可以显示qtl位点的贡献率。在此希望高手指点一下，或者告诉一下qtl位点的贡献率计算公式。万分感激！
friend
统计学方法可以决绝楼猪的问题么？！看来实在不才，看都没看懂。
bleat192
奇怪的是基因贡献率这个东西应该是有个什么定义的吧
hunter_lee
用的方法不一样，如果用方差组分估计可以得到QTL的方差，由于所用的软件将QTL作为固定效应来做的，所以要想估算QTL的方差，必须知道相应QTL等位基因的频率，这样可以用频率和效应来计算QTL方差。剩下的怎么干，我相信楼主应当知道吧。
shfujim
你到那个软件的网站上问问看
wanhongshen
楼主的问题是具体到你用的QTL作图软件，可以到软件介绍里看到·
wanhongshen
[quote]引用第2楼bleat192于2008-05-18 11:20发表的“”:
奇怪的是基因贡献率这个东西应该是有个什么定义的吧[/quote]
就是该QTL（数量性状位点）位点解释多少表性变异！
wanhongshen
[quote]引用第1楼friend于2008-05-18 00:30发表的“”:
统计学方法可以决绝楼猪的问题么？！看来实在不才，看都没看懂。[/quote]
楼主所用的软件是基于统计学方法的，只不过模型是自己建立的而后应用到软件中去的
