xfh 大家好，我不是数学出身，对统计不太擅长，请教大家。 我有几个样本，测得基因组DNA甲基化，数据是这样的： 每个样本的数据是这样的， 染色体 起始坐标 终止坐标 甲基化值 chr1 1121 1621 100 chr1 2000 2500 68 ... ... ... ... chr2 ... ... ... ... ... 各个样本间的 坐标区域个数不一定一样，并且有许多不同的区域，我想问一下，做聚类前，数据要先处理成什么标准。谢谢！！！！！
wanhongshen 统计出所有样本的测到的甲基化位点，材料间有这个甲基化位点的读1,没有这个甲基化位点的读0,然后进行聚类分析。 如在你所有材料测得甲基化位点有如 chr1 68 100 1121 1621 2000 2500 那么 第一个样则为 chr1 0 1 1 1 0 0 第二个样 则为 chr1 1 0 0 0 1 1 然后用NTsys 或者其他聚类分析
