回复 第1楼 的 wwwruc：这是个什么装法啊？没见过……要么纯粹apt-get install，让系统自己去解决依赖的问题（一般情况下会问你要不要装依赖的包）；要么自行下载源代码包，用./configure && make && make install的方式从头编译安装，但这种方法就需要你把依赖包一个个都装好了，比如你这里报错说缺了头文件X11/Intrinsic.h，那么你就抬手Google一下，看看这是哪个包的，然后你就会发现它来自于libxt-dev，所以你就先装好libxt-dev（无论是apt-get install libxt-dev还是用新立得还是别的方式），然后再configure看缺什么，缺什么就装什么，不知道的就Google。R的依赖包很多，如果你不熟悉，那么从源代码编译可能会很有挫败感，但大多数问题Google都能得到答案。如果没有什么特殊要求，还是打开新立得管理器，在那里面安装吧。
回复 第3楼 的 nan.xiao：手工装的时候不要指定./configure的--prefix选项，这样每次都装在同一个位置，不会混乱了。
