台湾人写的:選擇最佳切點?
所謂 Youden index 指的是 sensitivity+specificity-1 的值。文獻上利用 Youden index
找最佳切點的做法,就是要使得 sensitivity+specificity 為最大。這種做法其實是
假設: 當犯了 false positive 與犯了 false negative 所必須付出的”代價”(或“損失”)
一樣時。
我用SPSS 做这个ROC 曲线,得到同一个cut-off对应的TP和FP应该是此消彼长的(即TP从大到小排,FP从小到大排),求TP+FP最大值 Youden index 来找最佳切点,但这个R程序中好像FP实际是倒着排的
spss
序号 cutoff TP 1-FP youden指数-1
1 3.58 1 1 1
2 4.74 1 0.995 1.005
3 4.91 0.992 0.995 0.997
4 4.93 0.992 0.989 1.003
5 4.94 0.992 0.984 1.008
6 4.96 0.984 0.984 1
7 4.98 0.984 0.979 1.005
8 5.02 0.984 0.973 1.011
9 5.08 0.984 0.968 1.016
10 5.14 0.984 0.963 1.021
11 5.2 0.984 0.957 1.027
12 5.2 0.984 0.952 1.032
13 5.23 0.976 0.952 1.024
14 5.26 0.976 0.947 1.029
15 5.28 0.976 0.941 1.035
16 5.31 0.976 0.936 1.04
17 5.32 0.976 0.93 1.046
18 5.33 0.968 0.93 1.038
19 5.34 0.968 0.925 1.043
20 5.34 0.968 0.92 1.048